medicusmundi trabaja en Guatemala desde 1993, principalmente en el fortalecimiento del sistema público de salud a través de dos líneas de intervención:

El desarrollo de modelos de gestión y atención integrales e incluyentes (promovida bajo las siglas MIS), lo que le ha permitido generar capacidades para la formulación técnica de procesos de gestión, programas de atención, procesos de vigilancia epidemiológica socio cultural, formación de personal sanitario y desarrollo de sistemas de información para el seguimiento de las acciones sanitarias. Además de trabajar la horizontalización programática o integralidad de la salud, que responden con alta eficacia a las prioridades y programas verticales de la política pública.
El trabajo en salud sexual y reproductiva, en la que el papel de actores comunitarios como promotores/as de salud y comadronas es central en la difusión de los derechos sexuales y reproductivos, con especial atención en la juventud, y en el aseguramiento de una atención integral y con pertinencia cultural. Así mismo, en la línea de defensa de los derechos de las mujeres, se aborda la violencia de género como problema de salud pública implicando a agentes sociales y públicos para, a través de su articulación y el fortalecimiento de sus capacidades, se impulsen políticas y servicios públicos para la atención de la violencia de género desde un punto de vista intersectorial.